Rekuperator do normalnego funkcjonowania wymaga istnienia w danym budynku kanałów wentylacyjnych dostarczających i usuwających powietrze z poszczególnych pomieszczeń. Już teraz konstruktorzy i architekci rezygnują w swoich projektach z tradycyjnej wentylacji grawitacyjnej na rzecz rekuperatorów. Instalacja systemu wentylacyjnego pod rekuperator nie jest wcale droższa niż zamontowanie klasycznych kanałów wentylacji.

Centrala wentylacyjna z wbudowanym rekuperatorem standardowo wyposażona jest w jedną parę wentylatorów. Jeden z nich ma za zadanie zasysać powietrze z zewnątrz do wnętrza budynku, drugi powoduje przepływ powietrza w odwrotnym kierunku – od wnętrza na zewnątrz. Instalacją taką kieruje specjalny włącznik znajdujący się przeważnie w centralnej części budynku. W tak zwanych inteligentnych domach system ten może być sterowany również poprzez komputer.